Struktur Organisasi STT Moriah
| JABATAN | NAMA |
|---|---|
| Ketua Sekolah Tinggi Teologi Moriah | Dr. Antonius Missa |
| Wakil Ketua I – Bidang Pendidikan & Akademik | Jenry E. C. Mandey, Ph.D |
| Wakil Ketua II – Bidang Keuangan, Sarana-prasarana dan SDM | Clarissa Maya Devi S.E., M.Ak |
| Wakil Ketua III – Bidang Kemahasiswaan | Dr. Josapat Bangun |
| Ketua Program Studi Sarjana Teologi | Tarisih, M.Th |
| Ketua Program Studi Sarjana Pendidikan Agama Kristen | Novida Dwici Yuanri Manik, M.Pd.K. |
| Ketua Program Studi Magister Teologi | Dr. Martinus Duryadi |
| Ketua Program Studi Magister Pendidikan Agama Kristen | Dr. Tumpal Pandiangan |
| Ketua Program Studi Doktor Teologi | Dr. Ramly Donald Belly Lumintang |
| Kepala Unit Penjamin Mutu Internal (LPMI) | Dr. Chandra Wahyuni Irawati |
| Kepala Lembaga Penelitian dan Pengembangan kepada Masyarakat (LPPM) | Dr. Sri Mulyani |
| Kepala Perpustakaan | Stanley Dethan, M.Hum |
| Kepala Asrama | Gabriel Dhandi, M.Pd |